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LSKBのVer8.0 メインページからの利用方法の概要の説明 13分
主に、トップページにあるメインメニューから、どのようなことができるかを紹介しています。

LSKB Ver8.0 簡易マニュアル Rev2
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その他のビデオライブラリでは以下の機能や使い方の紹介を行っています。
マニュアルチャンネル
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LSKB Ver8.0簡易マニュアル(本ビデオと同一)(New)
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Biomarker探索方法(New)
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テーブルビュアーの使い方
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テキストマイニング方法の活用方法
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ElpisMap用ワークフローの使い方
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LSKB Ver7.0簡易マニュアル
機能紹介チャンネル
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Worlflow ツール概要紹介
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GO-MoA解析概要紹介
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タンパク質をハブとする情報と創薬への展開
メインメニュー概要

タブメニュー概要


Main Menu
メインのトピックスメニューを表示します。主に利用する機能やサマリーレポートなどの入り口です。
【着目ポイント】
・遺伝子に関連する疾患、化合物、アッセイ、パスウェイ、組織別発現情報を参照できます。(BERTで評価した関係性のクラス分類や、疾患との関連の強さなど)
・タンパク質から疾患、化合物、アッセイ、Similar Proteinに関する情報を参照できます。
・化合物に関連するPharmacology、遺伝子、ADMEやToxicityを含むアッセイ、Clinical Trial、Safety、特許、パスウェイ情報などが参照できます。
・アッセイ情報は、ターゲットと化合物情報を活性値とともに探せます。
・Assay Targetはタンパク質キーワードからアッセイ情報を探します。
・MoAからターゲットと関連する疾患や薬剤を参照できます。
・Toxicity & Side Effectsでは、各種毒性や副作用タームをクラス分類などとテーブル化し、各Toxicity項目 の詳細へ導きます。
・2020年から2021年でトレンドとして抽出された各キーワードを参照できます。
・疾患分類から共通疾患の標的タンパク質を比較し、タンパク質の類似性とタンパク質クラスをまとめた情報を参照できます。
Multiple Keywords/IDs
複数のキーワード・IDから検索を行い、アノテーションリストや複数の関連情報を取り纏め、目的に応じ重要な関連情報をランキング表示します。
【着目ポイント】
・遺伝子やタンパク質から作成済みワークフローによる関連情報の取得が可能です。
・遺伝子やタンパク質からドメインの共通性やPDB情報から 化合物を取得できます。
・複数のターゲットをアノテーション情報に基づきランキングできます。
・発現実験情報を経由してその実験や利用している化合物などの情報を参照できます。(発現実験データはGDS,Array Expressのアノテーションに限定)
・複数の遺伝子から疾患の情報によりランキングするDisease Explorerがここから利用出来ます。
・化合物からはSDFファイルの一括取得やターゲット予測が出来ます。
・Target Explorer では 疾患から複数のデー タを串刺し検索により ランキングを伴うターゲット探索が可能です。
・複数の疾患から薬剤のMoAとそのターゲットのGO情報により、生物学的機能をベースとした新しいターゲットや有意な化合物を取得出来ます。
・PMIDのリストからオントロジータームを利用した文献検索のウイザードが利用できます。
簡易ビデオマニュアル
メインメニュー概要
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テキストマイニング方法の活用方法
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ElpisMap用ワークフローの使い方
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LSKB Ver7.0簡易マニュアル
マニュアルチャンネル
マニュアルチャンネル

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Biomarker探索方法V8
08:57
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LSKB Ver8.0 簡易マニュアル Rev2
12:54
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ElpisMap用ワークフローの使い方
00:32
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テーブルビューアーの使い方
04:54
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テキストマイニング情報の活用方法
06:41
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【ビデオライブラリー】機能紹介チャンネル
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Worlflow ツール概要紹介
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GO-MoA解析概要紹介
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タンパク質をハブとする情報と創薬への展開
機能の紹介
機能の紹介

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Workflow Tool概要紹介
03:28
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GOMoA機能の概要紹介
05:14
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タンパク質をハブとする情報と創薬への展開
16:21
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【ビデオライブラリー】マニュアルチャンネル
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