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Proteins

タンパク質に関連する疾患、化合物、アッセイ、Similar Proteinに関する情報を参照できます。

【着目ポイント】
・Similar Proteinで、PoSSuM、BLAST、RPS-Blast、Delta-Blast、CD-Hitで評価したクエリーと類似タンパク質と共通活性化合物を探せます。
・ターゲット関連疾患はUMLSの疾患カテゴリーでまとめられ、疾患を簡単にグループ化できます。
【クエリー】
Protein Name, Entry Name, UniProt ACC, PDB ID Molecular Weight, Assay ID
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【検索結果タブの概要】
Summary(ターゲットとファミリーの情報とPubMedテキストマイニング情報など)
PDB(タンパク質に関連するPDB)
Annotation
 Feature(タンパク質の構成要素(配列DBのFeature))
 GO Function(GO)
 References(タンパク質DBに登録のある文献)
 Domain(PFAMとInterProのドメイン)
Similar Protein(PoSSuM、BLAST、RPS-Blast、Delta-Blast、CD-Hitで評価したクエリーと類似タンパク質と共通活性化合物)
Drug(薬剤情報で、MoAやPhase、ATC Classでの分析が可能)
Disease(ターゲット関連疾患はUMLSの疾患カテゴリーでまとめられ、疾患を簡単にグループ化できます。各Phaseでの状態などの分析が可能です。)
Assay
 Single Protein Assay(Single Protein Assayの活性値、化合物情報が分析可能)
 Assays(タンパク質がアッセイターゲットに含まれるアッセイ情報のサマリー、Assay Type, Target, Descriptionなどを用いて分析が可能)
 Activities(バッチ処理で、タンパク質の活性情報を化合物とともにまとめたテーブルを作成)

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