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Tree Browser
Tree Browserの開始
![Open_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_9fac778d75e3422b9c3bb0509ae32345~mv2.png/v1/fill/w_267,h_490,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/Open_TreeBrowser.png)
メインメニューのTree Browserをクリックして起動してください。
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Protein
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Chemical
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Taxonomy
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Disease
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Tissue
の分類で、それぞれCllasification可能なデータをツリー状に分類して検索する仕組みです。
例えば、上位の疾患グループからすべての疾患をクエリーとしてターゲットを求める検索などに利用できます。
Tree Browserの分類構成
![about_treebrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_22f82cf1af154d73a945b60e97ca05f5~mv2.png/v1/fill/w_758,h_418,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/about_treebrowser.png)
Tree Name | Description |
---|---|
EC Classification | EC Classification: 酵素の分類(EC) |
GPCR SARfari | GPCR SARfari: GPCR 分類(ChEMBL) |
Kinase SARfari | Kinase SARfari: Kinase 分類(ChEMBL) |
Protein Target | Protein Target: Proteinの 大分類 |
Pharmacological Action | Pharmacological Action:MeSHでの薬理作用分類 |
ATC Classification | ATC Classification:解剖治療化学分類法 ATCコード |
Taxonomy | Taxonomy:生物種分類 |
MeSH Disease | MeSH Disease: MeSHでの疾患分類 |
ICD-10 | ICD-10: ICD-10での疾患分類 |
MeSH Anatomy | MeSH Anatomyの組織分類 |
操作例
MeSH Diseaseを利用して、検索した疾患の上位にネストした疾患IDを検索に利用する例
![step1_treebrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_ca3f7e3420ba495482c7ca9905ad7e02~mv2.png/v1/fill/w_759,h_285,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/step1_treebrowser.png)
Treeを開くと最上位のクラスが表示されます。左の+ボタンで下位のクラスを開くか、検索します。
![MeSH_Disease_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_3d3cf9e7268e43039a467a8692c7ff9f~mv2.png/v1/fill/w_600,h_465,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/MeSH_Disease_TreeBrowser.png)
検索を行うと、候補リストが表示されるので選択してください。
![DiseaseSearch_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_f3dbca13f0264fc5aad9a9cacbc4a089~mv2.png/v1/fill/w_595,h_88,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/DiseaseSearch_TreeBrowser.png)
疾患を選択
![SelDisease_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_66a023c7aa8d4136a9e1f0b861c9c125~mv2.png/v1/fill/w_600,h_325,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/SelDisease_TreeBrowser.png)
疾患を選択すると、階層とともに表示されます。
更に疾患をクリックするとサブメニューが表示されますので、ここではSend Following Disease IDを選択します。
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Link to MeSH: MeSHへリンク
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Details: 当該情報のDetails
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Relation Search: 文献検索画面 へ
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Send Keyword/ID Search: Diseaseの検索画面に選択したTermを送付
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Send Following Disease ID: 下層のTermのIDをMultiple Keyword/ID へ送付
![SendDisease_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_94de5ab19cd64124a71d849a0226c861~mv2.png/v1/fill/w_599,h_480,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/SendDisease_TreeBrowser.png)
送られたIDを次の検索に利用
Tree Browserから 各種IDが コピーされ更に次の検索へ移行が可能
ここではマルチの疾患IDから検索する画面に推移する。
![SendMultipleDisease_TreeBrowser.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_8e8b443248044a1db7d93c89a168a257~mv2.png/v1/fill/w_600,h_252,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/SendMultipleDisease_TreeBrowser.png)
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