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Tree Browser

Tree Browserの開始
Open_TreeBrowser.png

メインメニューのTree Browserをクリックして起動してください。

​

  • Protein

  • Chemical

  • Taxonomy

  • Disease

  • Tissue

​

の分類で、それぞれCllasification可能なデータをツリー状に分類して検索する仕組みです。

例えば、上位の疾患グループからすべての疾患をクエリーとしてターゲットを求める検索などに利用できます。

Tree Browserの分類構成
about_treebrowser.png
Tree Name
Description
EC Classification
EC Classification：　酵素の分類（EC)
GPCR SARfari
GPCR SARfari： GPCR　分類（ChEMBL)
Kinase SARfari
Kinase SARfari： Kinase 分類（ChEMBL)
Protein Target
Protein Target： Proteinの 大分類
Pharmacological Action
Pharmacological Action：MeSHでの薬理作用分類
ATC Classification
ATC Classification：解剖治療化学分類法 ATCコード
Taxonomy
Taxonomy：生物種分類
MeSH Disease
MeSH Disease： MeSHでの疾患分類
ICD-10
ICD-10：　ICD-10での疾患分類
MeSH Anatomy
MeSH Anatomyの組織分類
操作例
MeSH Diseaseを利用して、検索した疾患の上位にネストした疾患IDを検索に利用する例
step1_treebrowser.png

Treeを開くと最上位のクラスが表示されます。左の＋ボタンで下位のクラスを開くか、検索します。

MeSH_Disease_TreeBrowser.png

検索を行うと、候補リストが表示されるので選択してください。

DiseaseSearch_TreeBrowser.png

疾患を選択

SelDisease_TreeBrowser.png

​疾患を選択すると、階層とともに表示されます。

​更に疾患をクリックするとサブメニューが表示されますので、ここではSend Following Disease IDを選択します。

  • Link to MeSH: MeSHへリンク

  • Details： 当該情報のDetails

  • Relation Search： 文献検索画面 へ

  • Send Keyword/ID Search： Diseaseの検索画面に選択したTermを送付

  • Send Following Disease ID： 下層のTermのIDをMultiple Keyword/ID へ送付

SendDisease_TreeBrowser.png
送られたIDを次の検索に利用

Tree Browserから 各種IDが コピーされ更に次の検索へ移行が可能

​ここではマルチの疾患IDから検索する画面に推移する。

SendMultipleDisease_TreeBrowser.png
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