Tree Browser

Tree Browserの開始
Open_TreeBrowser.png

メインメニューのTree Browserをクリックして起動してください。

  • Protein

  • Chemical

  • Taxonomy

  • Disease

  • Tissue

の分類で、それぞれCllasification可能なデータをツリー状に分類して検索する仕組みです。

例えば、上位の疾患グループからすべての疾患をクエリーとしてターゲットを求める検索などに利用できます。

Tree Browserの分類構成
about_treebrowser.png
Tree Name
Description
EC Classification
EC Classification: 酵素の分類(EC)
GPCR SARfari
GPCR SARfari: GPCR 分類(ChEMBL)
Kinase SARfari
Kinase SARfari: Kinase 分類(ChEMBL)
Protein Target
Protein Target: Proteinの 大分類
Pharmacological Action
Pharmacological Action:MeSHでの薬理作用分類
ATC Classification
ATC Classification:解剖治療化学分類法 ATCコード
Taxonomy
Taxonomy:生物種分類
MeSH Disease
MeSH Disease: MeSHでの疾患分類
ICD-10
ICD-10: ICD-10での疾患分類
MeSH Anatomy
MeSH Anatomyの組織分類
操作例
MeSH Diseaseを利用して、検索した疾患の上位にネストした疾患IDを検索に利用する例
step1_treebrowser.png

Treeを開くと最上位のクラスが表示されます。左の+ボタンで下位のクラスを開くか、検索します。

MeSH_Disease_TreeBrowser.png

検索を行うと、候補リストが表示されるので選択してください。

DiseaseSearch_TreeBrowser.png

疾患を選択

SelDisease_TreeBrowser.png

​疾患を選択すると、階層とともに表示されます。

​更に疾患をクリックするとサブメニューが表示されますので、ここではSend Following Disease IDを選択します。

  • Link to MeSH: MeSHへリンク

  • Details: 当該情報のDetails

  • Relation Search: 文献検索画面 へ

  • Send Keyword/ID Search: Diseaseの検索画面に選択したTermを送付

  • Send Following Disease ID: 下層のTermのIDをMultiple Keyword/ID へ送付

SendDisease_TreeBrowser.png
送られたIDを次の検索に利用

Tree Browserから 各種IDが コピーされ更に次の検索へ移行が可能

​ここではマルチの疾患IDから検索する画面に推移する。

SendMultipleDisease_TreeBrowser.png