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Chemical Structure
化合物構造検索とターゲット予測を行います。
【着目ポイント】
・構造検索はワークフローのアイテムとしており、情報取得の重要な要素になります。
・化合物DB はサブセット化し検索時間の短縮が可能で す。
・検索結果から直接化合物の各種アノテーションを参照できます。
・構造から類似性によるターゲット予測と活性値の加重平均による親和性の予測を行います。
【クエリー】
化合物構造
【検 索方法とサブセット】
化合物構造検索で利用できる検索方法とデータベース
ーーー 検索方法 ーーー
・Exact Match
・Substructure Search
・Framework Search
・Similarity Searchを用いたTarget Prediction
・Similarity Searchと同じFrameworkを用いたTarget Prediction
・Similarity SearchとMutualFrameworkを用いたTarget Prediction
・Mutual Frameworkを用いたTarget Prediction
・Substructure Searchを用いたTarget Confirmation
ーーー 化合物構造検索対象のサブセット ーーー
・Small Molecule collection
・論文に関連付けられた化合物
・治療薬
・ChEMBL
・ChEBI
・UNII
・Binding DB
・Natural Products
・アッセイ情報のある化合物
・辞書内にある化合物全て
・PubChem
・ZINC
・Patent
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