Predefined Workflow List
Activity Finder Example: actives for human p38
任意キーワードでタンパク質を検索し、活性値と化合物を収集(human p38を例として入力済)
Target prediction from LSKBChemID
LSKB ChemIDで化合物を与えて類似化合物を検索し、それらのアッセイデータを参照して入力した化合物の作用するターゲットを予測
SDF file preparation for active chemicals from Protein
タンパク質のIDや番号を指定してアッセイデータを収集し、関連化合物を特定してSDファイルに活性データと共に出力する
Chemical Finder Ex.2 :from EC number in human
指定したEC番号に紐づくタンパク質(HUMAN)を収集し、関連するPDB結晶構造データと、PDBリガンド分子を収集し、それらの関連するアッセイ情報を検索する
Chemical Finder Ex.3 from Protein Classification in Rat
「指定した生物種」の「指定した種別のタンパク質」に対するアッセイデータ中の活性値と、対応する化合物一覧を検索する(Ratを例として入力済)
Target prediction by Chemical Structure
指定した化合物の類似化合物を検索し、検索結果化合物の活性値から、最初に指定した化合物のターゲット候補を探索する