top of page
● Query
● Output
EC番号(UI上で選択)
タンパク質・遺伝子テーブル
化合物テーブル
PDBテーブル・PDBリガンドテーブル
活性値テーブル
EC番号を指定してたんぱく質を選択し、それに対応するPDB情報とPDB中のリガンドが関与する活性値一覧を表示する。たんぱく質の選択条件として、TAXID=9606(HUMAN)を指定済み。（変更可能）
活性値収集時の条件として以下の3つの条件を変更することが可能。
１）Retrieve activities without target protein entry name
ターゲットタンパク質名称がENTRY_NAMEで特定されていない情報であっても出力する
２）Retrieve activities without P_ACT value
LSKB統合アッセイのテーブルでP_ACTに値が入っていないような情報であっても出力する
３）Retrieve activities without ASSAY_TYPE
LSKB統合アッセイのテーブルでASSAY_TYPEに値が入っていない情報であっても出力する
● お試し用サンプルファイル
外部からの入力データ指定は不可
bottom of page