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Predefined Workflow List

(Modified) Ligand table from Protein

ID/番号で蛋白質を検索して、対応するPDBIDを収集、PDBのタンパク質情報・リガンド情報を収集して化合物一覧表を生成する

Activity collection for ElpisMap by target ID

ID/番号で蛋白質を検索して、アッセイデータ中の活性値と化合物を収集し、ElpisMapへの連携用リンクを作成する

Seek Gene/Protein by identifiers

ID/番号で蛋白質を検索して、基本情報を収集する

Seek Compoundn by LSKB ChemID, then Generate SDF

LSKB ChemIDで化合物を与えてSDファイルを生成する

Seek Compoundn by Structure Search

指定した化合物の類似化合物を検索して一覧表として出力する

Standard structure search from SD file/SMI file

指定したファイル中の化合物の類似化合物を検索して一覧表として出力する

Standard target prediction from SD file/SMI file

指定したファイル中の化合物の類似化合物を検索し、それらのアッセイデータを参照して入力した化合物の作用するターゲットを予測

Chemical Finder Ex.2 :from EC number in human

指定したEC番号に紐づくタンパク質(HUMAN)を収集し、関連するPDB結晶構造データと、PDBリガンド分子を収集し、それらの関連するアッセイ情報を検索する

Chemical Finder Ex.3 from Protein Classification in Rat

「指定した生物種」の「指定した種別のタンパク質」に対するアッセイデータ中の活性値と、対応する化合物一覧を検索する(Ratを例として入力済)

Activitiy collection from Taxonomy ID

生物種を指定して、アッセイデータから活性値を収集する

Target prediction by Chemical Structure

指定した化合物の類似化合物を検索し、検索結果化合物の活性値から、最初に指定した化合物のターゲット候補を探索する

Ligand table from PDB ID

PDBIDから、対応するタンパク質情報・リガンド情報を収集して化合物一覧表を生成する

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