Classification and Comparison of Gene-Disease Associations using BioBERT and PubMedBERT on GeneRIF Data

LSKBのフロンティア　BERT（MNLI）文献解析とChatGPTでわかること

LSKB の最新版 Ver8では文献情報（PubMed）のBERTによる疾患と遺伝子の関係性解釈機能を拡張し、毒性関連遺伝子、疾患標的への活用などの探索機能が強化されました。中でも疾患からのターゲット探索やバイオマーカー探索機能を更新しています。
今回は、LSKB Ver8の新機能の紹介に加え、三重大学院医学系研究科の田中利男先生をお招きして、LSKBの安全性評価への応用を講演していただきました。

『AI解析データの活用による疾患標的、毒性標的探索への応用』
・緑川 淳（(株)ワールドフュージョン）「BERTによる PubMedの解釈と毒性、疾患標的への活用」
・田中 利男（三重大学院医学系研究科）「次世代ゼブラフィシュ発生毒性とLSKB毒性機構解析システム」
・緑川 淳（(株)ワールドフュージョン）「タンパク質情報の高次利用とWorkflowによる効率化」

BERTによる情報の分類と統合データを活用した疾患/毒性の標的探索

タンパク質のポケット類似性を利用した探索方法をLSKBに導入し、さらに分子設計ソフトMOEの連携を強化して、より多くの方にご利用いただけるようにバージョンアップを実施しています。

今回は、産業技術総合研究所　富井健太郎　先生と、株式会社モルシス　池上貴史　先生をお招きし、富井先生には タンパクのポケット類似性検索方法の詳細、池上先生には MOEとLSKBの連携による創薬の効率化についてご紹介させていただきます。

演題番号：P-273
演題名：CLARITYPV: 薬物モニタリングとファーマコビジランスのためのAIベースの予測分析と統合されたトランスレーショナルセイフティデータ

LSKBターゲット探索、MOE連携のメリット、視覚化によるリード創薬の見極め

株式会社モルシスの池上様、小野薬品工業株式会社の黒野様のご協力の下、LSKB WEBセミナーを実施しました。

創薬支援ナレッジデータベース「LSKB ver７」をリリースしました。それに伴い新しい機能等を含めたWEBによる技術セミナーを開催しましたので、以下に発表資料を共有いたします。

AI 学習で作成した MoA データと意思決定支援ツールの導入と、HTSデータの可視化による意思決定支援、及びケモターゲット社のClarity PVについて紹介しました