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LSKB Ver Release note
トピック
Title | Menu |
|---|---|
トップページのGUIを刷新しました。 | トップページ |
トップページのメニューに新機能「ElpisMap」を追加しました | トップページ |
トップページのメニューに新機能「Workflow」を追加しました。 | トップページ |
トップページの「Main Menu」タブに「Trend of 2019-20’ PubMed Data」のリンクを追加しました。直近２年のオントロジーエントリー（Gene, Disease, Chemical, Taxonomy, Function）の文献数の推移のトレンドをランキング形式で参照できます。 | トップページ |
統合オントロジーDB（Gene, Disease, Chemical, Taxonomy, Tissue, Function, Phenotype）のエントリーのDetailsページのタブレイアウトを右部から左部に移動しました。また、合わせてSummaryタブのレイアウトを統一されたデザインポリシーにて刷新しました。 | エントリ ーDetailsページ |
深層学習におけるBERTの固有表現抽出用モデルにてPubMed論文からMoA データを抽出し、統合機能用語オントロジーDBのデータソースとして導入しました。 | データベース |
深層学習におけるBERTのMNLIモデル（仮説と前提文の含意関係を判断）にてGeneRIFの文章から遺伝子vs疾患の関係性を推論した結果のデータを導入しました。 | データベース |
統合機能用語オントロジーDBのデータソースとしてTherapeutic Target Database（TTD）のデータを追加しました。 | データベース |
化合物キーワード検索結果ページのビューを刷新しました。結果ページでは各ターム毎に紐づく構造エントリーをConfidence Scoreを参照しながら選択することができます。 | 化合物キーワード検索結果ページ |
テーブル表示機能の更新 | ※ 以下のタブのテーブル表示機能を変更
・化合物エントリーのDetailsページのDiseaseタブ
・化合物エントリーのDetailsページのGeneタブ
・化合物・疾患・遺伝子・フェノタイプ・組織臓器エントリーDetailsページのGene Expressionタブ
・疾患エントリーのDetailsページのDrugタブ
・疾患エントリーのDetailsページのClinical Trialタブ
・疾患エントリーのDetailsページのGeneタブ
・疾患エントリーのDetailsページのGO Rankingタブ
・疾患エントリーのDetailsページのTissueタブ
・機能用語エントリーのDetailsページのDrugタブ
・機能用語エントリーのDetailsページのDiseaseタブ
・遺伝子エントリーのDetailsページのChemicalタブ
・遺伝子エントリーのDetailsページのDiseaseタブ
・タンパク質エントリーのDetailsページのDrugタブ
・タンパク質エントリーのDetailsページのSimilar Proteinタブ
・タキソノミーエントリーのDetailsページのDiseaseタブ
・組織臓器エントリーのDetailsページのDiseaseタブ
・組織臓器エントリーのDetailsページのSpecific Expression Geneタブ
・バッチ機能Multi Disease ID 2 Diseaseの処理結果ページ
・PDB List (Disease vs Tissue) |
直近２年のオントロジーエントリーのトレンドランキング参照機能 | トップページ |
Tissue関連Species specific expression リスト機能 | Tissue Details ページ |
トップページのメニューに新機能「Workflow」を追加しました。 | Workflow |
ワークフローで化合物構造のファイルからの読み込み機能でSMILESファイル（Daylight SMILESの文字列）からの読み込みに対応しました。 | Workflow |
ワークフローにBlastP/DeltaBlast/RPS Blastを利用した類似たんぱく質検索用の部品を追加しました | Workflow【Search similar proteins found by Blast, DeltaBlast and RPS-Blast】 |
ワークフローにPossum/CDHit掲載の類似たんぱく質検索用の部品を追加しました | Workflow【Search similar proteins by both Blast and Possum】 |
化合物一覧表に分子量などのプロパティを格納した際、ElpisMapアプリケーションに投入する連携部品を追加しました | Workflow【Generate TSV file, for ElpisMap/scatterPlot application |
トップページのメニューに新機能「ElpisMap」を追加しました | ElpisMap |
統合アッセイDBのアッセイターゲットの表示にターゲットタイプの表記を追加しました。 | アッセイターゲットの表示ページ |
Taxonomy Details ページの「Assay」タブのリストを、当該のTaxonomyをOrganismターゲットとするデータのみに絞り込むよう機能を更新しました。 | Taxonomy Details ページ |
統合オントロジーDBのエントリーのDetailsページにキーワード検索から遷移した時に、ページの上部に検索クエリのタームの表示を追加しました。 | 統合オントロジーDBのエントリーのDetailsページ |
統合オントロジーDBのエントリーのDetailsページにて代表名がテキストマイニング非対象の時、その旨の表示を追加しました。 | 統合オントロジーDBのエントリーのDetailsページ |
化合物キーワード検索結果ページのビューを刷新しました。結果ページでは各ターム毎に紐づく構造エントリーをConfidence Scoreを参照しながら選択することができます。 | 化合物キーワード検索結果ページ |