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2021/12/20

20211220 LSKB WEBセミナー

創薬支援ナレッジデータベース「LSKB ver7」をリリースしました。それに伴い新しい機能等を含めたWEBによる技術セミナーを開催しましたので、以下に発表資料を共有いたします。

【セミナー内容】
「LSKB」はすでに多くの創薬に関わる方々に導入頂いており、日々皆様の意見を組み込みながら進化し続けております。

メカニズム分析や創薬ターゲット探索の実施に不可欠なデータベースやアルゴリズムを搭載した最新バージョンの「LSKB Ver7」の注目新機能について紹介しました。
BERTを用いたMoA取得と解読エンジンの評価を行った技術資料を紹介しました。

1) LSKB Ver.7 概要
【20211220_Webinar_Part1.pdf】

メカニズム分析や創薬ターゲット探索には、多面的なデータを利用する必要があり、目的に合わせたデータ探索を可能にする専用のワークフローツールを搭載しました。これにより、複数による共同作業や同一探索手法の共有など、大幅な探索の効率化を実現します。
特に、AIにより取得したMoA(作用機序)を従来のMoAに統合し、充実したLSKBの各種オントロジーと相互作用情報 の解析による 疾患の新しいターゲットや化合物の探索手法を提供しています。

2) 多様なデータを自在に取得するWorkflowと 意思決定ツール Elpis Map
【20211220_Webinar_Part2.pdf】

多様なデータを自在に取得するワークフローツールを利用することで、LSKBのデータベースを目的に合わせた検索フローを作成することができます。作成されたワークフローは共有し、分担作業など様々な効率化が期待できます。
意思決定支援ツールとして、小野薬品工業様の開発したElpis MapをLSKBに標準搭載いたしました。Elpis Mapは散布図と分布図を統合し、視覚化による意思決定を支援するツールです。今回はHTSデータの視覚化により、GO, No-Go, No-Needを判断しやすくする機能を搭載しました。セミナーではこれらをご紹介いたします。

3) AIによるMoA取得と読解エンジンとしての可能性
【20211220_Webinar_Part3.pdf】
AI(BERT) による 新しい MoA 抽出と 読解エンジンとしての活用の可能性で、以下検討した内容を報告します。​
●BERTを使った新規MoA抽出プロジェクト実行環境
●BERTを使ったGeneRIFの遺伝子vs疾患の関係性の判別

202112LSKB.zip (6.5MB)

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