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Gene ID to Domain --- Protein --- Assay Target - - - Chemical

遺伝子リストから 共通ドメインをもつアッセイターゲット情報を取得します。

遺伝子から共通ドメインを経由でアッセイを探す方法で、同じドメインを持つターゲットという角度で広く情報が探せます。
標的するタンパク質にアッセイ情報がない場合に共有ドメインを持つタンパク質に対する活性化合物を探すことができます。 入力したGene IDのドメインが共通するタンパク質のうち、Assayのターゲットになっているものを探します。EC50, IC50, Kd, Ki と Bind, Inhibit の出力を選択します。BindはKd, EC50の件数を、Inhibitは Ki, IC50の件数をマージします。

その結果は 以下のテーブルで表示されます。
・Gene ID:Input した 遺伝子ID
・Entrez Gene ID: Input したEntrez Gene ID
・Gene Information:Input した Gene Name
・UniProt Entry :遺伝子と共通ドメインをもち、Assay Targetであるタンパク質のUniProt Entry
・GO:提示されたタンパク質のGO
・Pathway:提示されたタンパク質のPathway
・# of Ref:提示されたタンパク質の基本論文
・ChEMBL Target:該当するChMEBL Target

以降 次のEndpointの件数
- 検索時 EC50, IC50, Kd, Ki を選択した場合
・EC50:EndpointをEC50とするこのターゲットアッセイの活性化合物数(リンク)
・Kd:EndpointをKdとするこのターゲットアッセイの活性化合物(リンク)
・IC50:EndpointをIC50とするこのターゲットアッセイの活性化合物(リンク)
・Ki :EndpointをKiとするこのターゲットアッセイの活性化合物(リンク)
- 検索時 Bind, Inhibit を選択した場合
・Bind:上記 EC50および Kdの合計数
・Inhibit :上記 IC50および Kiの合計数

検索に利用するクエリーと例
【Entrez Gene IDリスト】
80332
163486
57628
4589
94103
サンプルクエリーデータ
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