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Target Keyword/ID(Gene or Protein)
たんぱく質名などのキーワードから、遺伝子、タンパク質、EC、Assan Target を一度に検索。
・Gene Symbol/Gene ID/Gene Name/Protein Name/UniProt Accession/Entry Name/EC number 他、任意のタ ーゲットの名前を入力として検索すると、Gene/Protein/EC/Target を同時に検索し、個別のタブにてヒットし たタームについて出力します。
・完全一致した場合は、Protein Detail 画面が直接表示されます。
【着目ポイント】
・幅広いキーワードで検索ができます。
・ChEMBL、BioAssayが同時に表示できます。
・Similar Proteinで、PoSSuM、BLAST、RPS-Blast、Delta-Blast、CD-Hitで評価したクエリーと類似タンパク質と共通活性化合物を探せます。
・ターゲット関連疾患はUMLSの疾患カテゴリーでまとめられ、疾患を簡単にグループ化できます。
![dummy.png](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_3d6bdff6bd61403fa69ee3c88783d868~mv2.png/v1/fill/w_668,h_379,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,enc_auto/dummy.png)
利用できるクエリー
Query Type | Query |
---|---|
Keyword | ・UniProt EntryName
・UniProt ACC
・PDB ID
・ChEMBL ID(Target)
・RefSeq RNA / mRNA / Protein
・Ensembl Transcript / Protein
・Entrez Gene ID・Gene Name / Symbol
・Protein Name
・Enzyme Class
・(Assay) Target Name |
出力タブ
Gene
Gene Symbol/Gene Name/Organism/GeneID/ 文献数/PDB 数/遺伝子発現実験数/Assay 数/MoA
Protein
Entry Name/Protein Name/Spicies/PDB 数/Assay 数/Assay Target/ MoA
EC
EC Number/ Class
Target
Target Name/Target Type/Entry Name/Organism/ Assay 数
Example
Chymaseで検索した時のGeneタブ情報
![Chymaseで検索した時のGeneタブ情報](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_768c237cda2a4ea1bd8d1f801870c827~mv2.png/v1/fill/w_52,h_28,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,blur_2,enc_auto/Chymase_SP_Assays.png)
Chymaseでヒットした遺伝子基本情報と、文献数(COUNT)、PDB登録数、Expression(Chymaseが一定以上発現変動を起こしている遺伝子発現実験数、AssayとMoA(作用機序)が表示されます。
Chymaseで検索した時のProteinタブ情報
![Chymaseで検索した時のProteinタブ情報](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_a541d19471d54883bda44c2bfd252cf2~mv2.png/v1/fill/w_52,h_28,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,blur_2,enc_auto/Chymase_SP_Assays.png)
Chymaseでヒットしたたんぱく質一覧が表示され、その基本情報と、PDB登録数、AssayとMoA(作用機序)が表示されます。
Chymaseをターゲットとするアッセイターゲット情報。
![Chymaseをターゲットとするアッセイターゲット情報。](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_7125c5ef0c6a4722922bb972dabfa164~mv2.png/v1/fill/w_50,h_28,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,blur_2,enc_auto/Chymase_SP_Assays.png)
Chymaseでヒットしたターゲット名(Name)、ターゲットタイプ、対象となるタンパク質エントリー、生物種とアッセイ数が表示されます。
アッセイの詳細やたんぱく質の詳細情報を参照できます。
Chymaseで検索した時のECタブ情報
![Chymaseで検索した時のECタブ情報](https://static.wixstatic.com/media/701dd8_2d511e4eb95345b08c2cd87e6fe4df7f~mv2.png/v1/fill/w_52,h_28,al_c,q_85,usm_0.66_1.00_0.01,blur_2,enc_auto/Chymase_SP_Assays.png)
ヒットした EC NumberとClass名 Chymaseが表示され、リンクをクリックするとこのクラスのEC詳細情報が表示されます
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